Militante del Partito comunista, Fastiggi fu arrestato nel 1937 per la sua attività antifascista. Deferito al Tribunale speciale fu condannato a 14 anni di reclusione. Ne scontò sette e, alla caduta del regime, lasciò il carcere di Civitavecchia e ritornò a Pesaro per dirigervi la locale Federazione comunista. Dopo l'8 settembre 1943 prese parte alla Guerra di liberazione e fu attivissimo organizzatore delle formazioni gappiste e ispettore delle Brigate partigiane "Garibaldi". Il 2 febbraio del 1944 Pompilio Fastiggi si trovava in missione presso le formazioni partigiane dell'Alto Metauro. Catturato dai fascisti fu tradotto nella caserma di Sant'Angelo e lì ucciso a colpi di pistola.